雖然民辦高校和獨立學院在本質上都是民辦院校，但是如果細分就會發現這兩類高校確實有很大區別。

1、獨立學院學生考研母體大學優勢更明顯，但在全國范圍上民辦院校學生考研更有優勢。因為獨立學院是“某某大學”的二級學院，它們在教學上存在聯系。

獨立學院是依托某某大學而辦，所以獨立學院很多老師都是來自本部大學，并且湖北工業大學工程技術學院、三峽大學科技學院、燕山大學里仁學院等這類院校和母體大學共校區，在這一塊獨立學院的學生考研母體大學認可度會比較高，也就相對容易考上本部大學研究生。

雖然獨立學院的學生更容易考上本部大學的研究生，但是我們都知道獨立學院原來是屬于三本，只不過后來很多省份取消了三本，這才讓獨立學院進入二本招生。但因獨立學院辨認度太高，其次是大家對于民辦二本的認可度不太高，所以這類院校已經在人們心中深深印下了“三本院校”的痕跡。

民辦院校由于后期更改校名與公辦院校在外表上幾乎沒有差異，所以在全國范圍了民辦院校考研更吃香。這也是為什么經常有聽到民辦院校的學生考上985、211的研究生，而獨立學院卻很少發生。

2、獨立學院師資很多來自母體一本大學，這一點比民辦學院更有優勢。雖說很多獨立學院和母體大學的交流并不多，特別是異地辦學的獨立學院，但是母體大學對其所屬獨立學院有不可推脫的管理責任，所以也就常聽到獨立學院的學生說“今天本部的老師又來講學了”或者是“我們學部主任都是來自本部下派”。

而民辦高校一切師資和資金投入都是由企業自己負責，而為了保證利益最大化，很多民辦高校固定老師總數非常少，很多老師都是兼職教師，師資流動率大對學生上課效果肯定是有一定影響。

3、用人單位對民辦學院和民辦獨立學院一視同仁。雖然民辦學院在校名上更像公辦院校，但是稍微高規格的企業都講究985、211，稍微次一點的單位也要本省知名度大的重點院校，所以民辦學院和民辦獨立學院在找工作時都只能達到“全日制本科”要求，除此之外沒有半點優勢。

4、獨立學院的學費一般比民辦學院低一點。這兩類學校都是高收費，但是民辦學院的收費往往比獨立學院更高。如：湖北省民辦高校武昌首義學院、文華學院、湖北商貿學院這些學校學費都在2萬/年（有增無減），而湖北省獨立學院湖北工業大學工程技術學院、三峽大學科技學院等民辦獨立學院學費都在1.6萬/年左右，相對來說少了3千元左右。

別看這3千元不多，但是上了民辦高校意味著你一年最少要花3萬元，特別對于貧困家庭來說：少3千元學費，就相當于為家里掙了1~2個月的工資。